Estudió danza en la Universidad de Chile y teatro en la Universidad Católica de Chile, carreras que abandonó al casarse. Durante las décadas del 60 y 70 incursionó en la ciencia ficción con cuentos que fueron incluidos en las antologías El señor de las mariposas y Angélica y el delfín. Estos relatos, en conjunto con la novela Del cosmos las quieren vírgenes de 1977 –que fue reeditada 29 años después de su primera y única publicación por Imbunche Ediciones– la posicionaron como un referente del género en Chile. La colección Ur fue escrita entre el año 1987 y 2001, y cada uno de los libros está dedicado a una nieta. Con esta colección, Imbunche Ediciones culmina el proyecto de reeditar toda su obra de ciencia ficción.

Elena Aldunate, como ella misma afirmó, odiaba la monotonía y el miedo, y le apasionaban la ciencia ficción, los gatos y el futuro de la Tierra.